Proteomické laboratórium
Proteomické laboratórium
Proteomická analýza umožňuje stanovenie a kvantifikáciu stoviek až tisícov jednotlivých bielkovín v biologickej vzorke. Využíva spojenie kvapalinovej chromatografie s hmotnostnou spektrometriou pre rýchlu a spoľahlivú identifikáciu sledovaných analytov. Proteomická analýza sa uplatňuje tak v základnom vedeckom výskume pri identifikácii bielkovín so zaujímavými vlastnosťami, ako aj pri aplikovanom biomedicínskom výskume pri stanovovaní rozdielnych proteínových profilov a identifikácii potenciálnych biomarkerov.
Infraštruktúra proteomického laboratória je vzájomne hardvérovo a softvérovo prepojená. Kvapalinové chromatografy (UHPLC, nanoHPLC) sú predradenými separačnými zariadeniami, ktoré sú fyzicky aj softvérovo prepojené s hmotnostnými spektrometrami (MALDI TOF/TOF, ESI-QTOF). Hmotnostné spektrometre využívajú dvojicu komplementárnych ionizačných techník, ktorých namerané dáta budú následne spracované na jednotnej softvérovej bioinformatickej platforme.
Proteomické laboratórium je plne vybavené základnými laboratórnymi prístrojmi na prípravu vzoriek a obsahuje nasledujúce kľúčové zariadenia:
- hmotnostný spektrometer pre charakterizáciu proteínov MALDI-TOF/TOF (ultrafleXtreme, Bruker),
- hmotnostný spektrometer s vysokým rozlíšením pre kvalitatívnu a kvantitatívnu proteomiku a metabolomiku ESI-QTOF (impactII, Bruker),
- kvapalinový chromatograf pre separáciu pepetidov – nanoHPLC (UltiMate 3000 RSLCnano System, Thermo Fisher Scientific),
- kvapalinový chromatograf pre separáciu v metabolomike a toxikológii s DAD detektorom (UltiMate 3000 System, Thermo Fisher Scientific),
- invertovaný mikroskop,
- prietokový cytometer (CytoFlex, Beckman Coulter).
Realizácia projektov s ITMS kódom 26210120041
Realizácia projektu BIOMEDIRES II
