Moderná medicína sa dnes neopiera len o klinické rozhodnutia v ambulancii či nemocnici. Stále viac stojí na systematickom uchovávaní biologických vzoriek a komplexných údajov, ktoré umožňujú spätnú analýzu, identifikáciu biomarkerov a vývoj personalizovaných liečebných postupov.

Biobankovanie predstavuje proces spracovania, uchovávania, systematizácie a sprístupňovania biologických vzoriek spolu s údajmi, ktoré sú s nimi prepojené.

V podmienkach Slovenskej republiky biobankovanie nie je samostatným odborom, ale organickou súčasťou poskytovania zdravotnej starostlivosti.

Čo dnes znamená biobankovanie

Biobanky už dávno nie sú iba „mrazničky so vzorkami“. Predstavujú komplexné systémy, ktoré prepájajú biologický materiál s dátami a vytvárajú integrované informačné prostredie pre výskum aj klinickú prax. Uchovávané sú nielen biologické vzorky – ako krv, tkanivá, DNA či RNA – ale aj rozsiahle klinické údaje, genomické a epigenomické dáta, informácie o životnom štýle či demografické charakteristiky pacientov.

Proces biobankovania zahŕňa celý rad odborných krokov – od samotného zberu vzoriek cez ich predanalytické spracovanie až po dlhodobé uchovávanie pri teplotách -80 °C alebo v kvapalnom dusíku. Kľúčovým prvkom je aj sofistikovaná správa údajov prostredníctvom špecializovaných informačných systémov (LIMS/BIMS), ktoré zabezpečujú sledovateľnosť, kvalitu a integritu vzoriek.

Takto budovaná infraštruktúra umožňuje vytvárať robustné datasety využiteľné v oblasti personalizovanej medicíny, farmakogenomiky, identifikácie biomarkerov či epidemiologických štúdií. Biobanky tak predstavujú jeden zo základných pilierov translational research – teda prekladu vedeckých poznatkov do klinickej praxe.

Biobankovanie na Slovensku

Na rozdiel od viacerých krajín EÚ, kde biobanky fungujú ako samostatné výskumné infraštruktúry, je na Slovensku biomedicínsky výskum vrátane biobankovania súčasťou zdravotnej starostlivosti podľa zákona č. 576/2004 Z. z.

Etické a právne aspekty

Biobankovanie je neoddeliteľne späté s vysokými etickými a právnymi nárokmi. Kľúčovým princípom je informovaný súhlas darcu. biobankovaní. Účastníci musia byť jasne informovaní o tom, ako budú ich biologické vzorky a osobné údaje spracovávané a používané vo výskume.

Neoddeliteľnou súčasťou procesu je anonymizácia alebo pseudonymizácia údajov a dôsledná ochrana osobných údajov v súlade s GDPR. Každý výskumný projekt musí byť posúdený a schválený príslušnou etickou komisiou, ktorá dohliada na dodržiavanie etických zásad počas celého trvania výskumu.

Biobanky a Open Science

Moderné biobanky sa stávajú súčasťou európskych a medzinárodných infraštruktúr, ako je BBMRI-ERIC, a riadia sa princípmi FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable).

Prepojenie na platformy, ako je European Open Science Cloud (EOSC), umožňuje medzinárodné zdieľanie dát, podporuje interoperabilitu systémov a zvyšuje reprodukovateľnosť výskumu. Takýto prístup posilňuje transparentnosť, efektivitu a globálnu spoluprácu vo vedeckej komunite.

Výzvy budúcnosti

Biobanky dnes čelia viacerým zásadným výzvam. Prudký nárast objemu genomických dát, najmä v dôsledku sekvenovania celého genómu, kladie vysoké nároky na dátové úložiská a výpočtovú infraštruktúru. Cloudové riešenia sa postupne stávajú nevyhnutnosťou.

Ďalšou výzvou je interoperabilita, integrácia údajov z rôznych biobánk a zdravotníckych systémov, ktoré často používajú odlišné štandardy a terminológiu. Rovnako dôležitá je otázka finančnej udržateľnosti, keďže dlhodobé uchovávanie vzoriek a dát si vyžaduje stabilné a systémové financovanie.

Prepojenie na vzdelávanie

Ak má byť biobankovanie prirodzenou súčasťou zdravotnej starostlivosti a nie „nadprácou“ k nej, je nevyhnutné systematicky vzdelávať budúcich zdravotníckych pracovníkov.

Je potrebné posilňovať ich porozumenie dátovej infraštruktúre, etickým princípom, digitálnym nástrojom a prepojeniu klinickej praxe s výskumom. Len tak možno zabezpečiť, aby biologický materiál a údaje, ktoré vznikajú v zdravotníckom systéme, boli využívané efektívne, bezpečne a v prospech pacientov.

Práve z tohto dôvodu je téma biobankovania súčasťou moderného vzdelávania v oblasti laboratórnej diagnostiky, vrátane Kurzu Medicínske Minimum (realizovaného  vďaka podpore Erasmus+ v rámci projektu CONED – 2024-1-SK01-KA210-VET-000248810), ktorý prepája teoretické poznatky s praktickým pohľadom na fungovanie moderných biomedicínskych infraštruktúr.

Vzdelávanie v tejto oblasti pomáha budovať generáciu zdravotníckych odborníkov, ktorí rozumejú nielen samotnej diagnostike, ale aj širšiemu kontextu správy vzoriek, dát a výskumných procesov, ktoré formujú budúcnosť zdravotníctva.

„Financované Európskou úniou. Vyjadrené názory a postoje sú názormi a vyhláseniami autora(-ov) a nemusia nevyhnutne odrážať názory a stanoviská Európskej únie alebo SAAIC. Európska únia ani organizácia udeľujúca grant za ne nepreberajú žiadnu zodpovednosť.”